Program keahlian akuntansi dan keuangan lembaga di SMK Muhammadiyah 1 Jatinom mempelajari tentang proses mengenali, mengukur, dan menghubungkan informasi ekonomi untuk memperoleh pertimbangan dan keputusan yang tepat oleh pemakai informasi yang bersangkutan.
Akuntansi dan Keuangan Lembaga (AKL) dapat juga diartikan sebagai suatu seni mencatat, mengklarifikasi, dan meringkas data keuangan untuk menunjukan kondisi keuangan dan hasil usaha suatu perusahaan.
Peserta didik diharapkan mampu untuk mencatat, menggolongkan, mengikhtisarikan/meringkasan, melaporkan, dan menganalisis keuangan. Proses tersebut akan berulang mulai dari transaksi keuangan sampai dengan penyusunan laporan keuangan.